可視セルにだけ一括で数式を貼り付ける方法はありません

でもいい方法があります

やり方ソートをかけて、連続するセル配置に直してから貼付ける。
表の左端に連続する数値を入れておき、順番を崩しても元に戻せるようにしておくと可能。

色つきのセルに飛びとびに計算式を入れる場合

表の左側に空白を設けて見出しから通し番号を入れます

見出し部分にソートをかけておきます

合計／前年の▼をクリックしセルの色で並べ替えをクリック

色をクリックすると色の行だけ行間が詰まります。

この状態で計算式を１つ入れ、下にコピーしてやります。

データの並べ替えで通し番号の列を基準にして昇順で並べ替えすれば元通りの順場に戻ります

ここではソートをかける文字を入れていないため色でソートかけていますが
通常では文字などの項目でソートをかけます。